MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Geodermatophilus obscurus DSM 43160 chromosome

Total Repeats: 168768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013757	CGTCGC	2	12	5	16	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013757	GCC	2	6	48	53	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_013757	CGAC	2	8	64	71	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013757	CAC	2	6	72	77	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_013757	CGA	2	6	94	99	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013757	GAT	2	6	116	121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013757	GCCCG	2	10	128	137	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_013757	CGT	2	6	162	167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013757	GT	3	6	205	210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013757	GAC	2	6	242	247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013757	GCGG	2	8	259	266	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013757	CGG	2	6	270	275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013757	CGA	2	6	280	285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013757	GGA	2	6	300	305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013757	GCA	2	6	388	393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284988630
16	NC_013757	CCCG	2	8	414	421	0 %	0 %	25 %	75 %	284988630
17	NC_013757	GGA	2	6	562	567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284988630
18	NC_013757	CGC	2	6	579	584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988630
19	NC_013757	CCG	2	6	585	590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988630
20	NC_013757	GGT	2	6	628	633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284988630
21	NC_013757	GC	3	6	643	648	0 %	0 %	50 %	50 %	284988630
22	NC_013757	AGG	2	6	651	656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284988630
23	NC_013757	CGA	2	6	679	684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284988630
24	NC_013757	GC	3	6	706	711	0 %	0 %	50 %	50 %	284988630
25	NC_013757	GAC	2	6	734	739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284988630
26	NC_013757	CCA	2	6	744	749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284988630
27	NC_013757	ACGC	2	8	756	763	25 %	0 %	25 %	50 %	284988630
28	NC_013757	CCG	2	6	765	770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988630
29	NC_013757	CGA	2	6	781	786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284988630
30	NC_013757	CCGGC	2	10	812	821	0 %	0 %	40 %	60 %	284988630
31	NC_013757	CGGC	2	8	825	832	0 %	0 %	50 %	50 %	284988630
32	NC_013757	GGC	2	6	863	868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284988630
33	NC_013757	CGA	2	6	877	882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284988630
34	NC_013757	TGC	2	6	897	902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988630
35	NC_013757	GCC	2	6	934	939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988630
36	NC_013757	CGC	2	6	942	947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988630
37	NC_013757	GCC	2	6	957	962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988630
38	NC_013757	GCG	2	6	963	968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284988630
39	NC_013757	GAG	2	6	978	983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284988630
40	NC_013757	CCG	2	6	1009	1014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988630
41	NC_013757	GC	3	6	1026	1031	0 %	0 %	50 %	50 %	284988630
42	NC_013757	CGC	2	6	1102	1107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988630
43	NC_013757	CTG	2	6	1190	1195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988630
44	NC_013757	CGCGG	2	10	1213	1222	0 %	0 %	60 %	40 %	284988630
45	NC_013757	GAG	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284988630
46	NC_013757	TCA	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284988630
47	NC_013757	CCGG	2	8	1296	1303	0 %	0 %	50 %	50 %	284988630
48	NC_013757	CCG	3	9	1315	1323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988630
49	NC_013757	CGA	2	6	1351	1356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284988630
50	NC_013757	GC	3	6	1372	1377	0 %	0 %	50 %	50 %	284988630
51	NC_013757	AGG	2	6	1389	1394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284988630
52	NC_013757	TTC	2	6	1397	1402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284988630
53	NC_013757	AGCA	2	8	1430	1437	50 %	0 %	25 %	25 %	284988630
54	NC_013757	TCA	2	6	1443	1448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284988630
55	NC_013757	GAA	2	6	1465	1470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284988630
56	NC_013757	GAC	2	6	1474	1479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284988630
57	NC_013757	AAG	2	6	1571	1576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284988630
58	NC_013757	GC	3	6	1662	1667	0 %	0 %	50 %	50 %	284988630
59	NC_013757	AGC	2	6	1701	1706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284988630
60	NC_013757	CGA	2	6	1753	1758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284988630
61	NC_013757	ATC	2	6	1784	1789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284988630
62	NC_013757	GGC	2	6	1792	1797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284988630
63	NC_013757	CCG	2	6	1800	1805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988630
64	NC_013757	GGA	2	6	1825	1830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284988630
65	NC_013757	CGCC	2	8	1867	1874	0 %	0 %	25 %	75 %	284988630
66	NC_013757	CCT	2	6	1932	1937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284988630
67	NC_013757	CGG	2	6	1939	1944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284988630
68	NC_013757	ACCAC	2	10	1950	1959	40 %	0 %	0 %	60 %	284988630
69	NC_013757	AAG	2	6	1976	1981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284988630
70	NC_013757	TGA	2	6	1992	1997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284988630
71	NC_013757	GCG	2	6	2002	2007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284988630
72	NC_013757	CCGC	2	8	2037	2044	0 %	0 %	25 %	75 %	284988630
73	NC_013757	CG	4	8	2054	2061	0 %	0 %	50 %	50 %	284988630
74	NC_013757	CGG	2	6	2075	2080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013757	CGG	2	6	2128	2133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013757	GTC	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013757	GTC	3	9	2168	2176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013757	GC	3	6	2187	2192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013757	CGA	2	6	2232	2237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013757	TC	3	6	2271	2276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013757	CGT	2	6	2291	2296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013757	CCGGC	2	10	2302	2311	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
83	NC_013757	GC	3	6	2310	2315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013757	TCG	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013757	CGT	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013757	GCCG	2	8	2395	2402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013757	GACG	2	8	2441	2448	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013757	GA	3	6	2475	2480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013757	CGG	2	6	2481	2486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013757	CCAC	2	8	2540	2547	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_013757	ACGG	2	8	2583	2590	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013757	TGA	2	6	2616	2621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013757	GCTGC	2	10	2675	2684	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_013757	GGA	2	6	2752	2757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013757	CGA	2	6	2761	2766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013757	GCC	2	6	2849	2854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988631
97	NC_013757	CAGC	2	8	2903	2910	25 %	0 %	25 %	50 %	284988631
98	NC_013757	CG	5	10	2942	2951	0 %	0 %	50 %	50 %	284988631
99	NC_013757	GCCGG	2	10	2993	3002	0 %	0 %	60 %	40 %	284988631
100	NC_013757	GCC	2	6	3029	3034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988631
101	NC_013757	CCG	2	6	3052	3057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988631
102	NC_013757	CG	3	6	3089	3094	0 %	0 %	50 %	50 %	284988631
103	NC_013757	CGT	2	6	3148	3153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988631
104	NC_013757	GTC	2	6	3162	3167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988631
105	NC_013757	GTGGCC	2	12	3201	3212	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284988631
106	NC_013757	CGA	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284988631
107	NC_013757	GAC	2	6	3267	3272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284988631
108	NC_013757	CGAC	2	8	3289	3296	25 %	0 %	25 %	50 %	284988631
109	NC_013757	GGC	2	6	3328	3333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284988631
110	NC_013757	CAC	2	6	3350	3355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284988631
111	NC_013757	GCCC	2	8	3368	3375	0 %	0 %	25 %	75 %	284988631
112	NC_013757	GGGGA	2	10	3450	3459	20 %	0 %	80 %	0 %	284988631
113	NC_013757	ACC	3	9	3489	3497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284988631
114	NC_013757	GCT	2	6	3500	3505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988631
115	NC_013757	CGC	2	6	3590	3595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988631
116	NC_013757	CGC	2	6	3628	3633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988631
117	NC_013757	GC	3	6	3668	3673	0 %	0 %	50 %	50 %	284988631
118	NC_013757	CGG	2	6	3674	3679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284988631
119	NC_013757	CGA	3	9	3683	3691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284988631
120	NC_013757	GAG	2	6	3702	3707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284988631
121	NC_013757	CGC	2	6	3779	3784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988631
122	NC_013757	C	6	6	3793	3798	0 %	0 %	0 %	100 %	284988631
123	NC_013757	GC	3	6	3799	3804	0 %	0 %	50 %	50 %	284988631
124	NC_013757	CCG	2	6	3832	3837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988631
125	NC_013757	CGAC	2	8	3862	3869	25 %	0 %	25 %	50 %	284988631
126	NC_013757	GGC	2	6	3875	3880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284988631
127	NC_013757	CCCG	2	8	3883	3890	0 %	0 %	25 %	75 %	284988631
128	NC_013757	C	6	6	3965	3970	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_013757	CGG	2	6	3987	3992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013757	AGG	2	6	4001	4006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013757	GCGG	2	8	4022	4029	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013757	GCG	3	9	4038	4046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013757	GCG	2	6	4070	4075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013757	CCGG	2	8	4102	4109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013757	GAG	2	6	4118	4123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013757	CGT	2	6	4131	4136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988632
137	NC_013757	GGC	2	6	4168	4173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284988632
138	NC_013757	GCGCC	2	10	4191	4200	0 %	0 %	40 %	60 %	284988632
139	NC_013757	GTC	2	6	4210	4215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988632
140	NC_013757	CCGCG	2	10	4280	4289	0 %	0 %	40 %	60 %	284988632
141	NC_013757	GGT	2	6	4290	4295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284988632
142	NC_013757	AGC	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284988632
143	NC_013757	TCG	2	6	4376	4381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988632
144	NC_013757	CGG	2	6	4383	4388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284988632
145	NC_013757	CGA	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284988632
146	NC_013757	CGG	2	6	4470	4475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284988632
147	NC_013757	CGG	2	6	4512	4517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284988632
148	NC_013757	GAC	2	6	4525	4530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284988632
149	NC_013757	GCC	2	6	4566	4571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988632
150	NC_013757	GCCGG	2	10	4624	4633	0 %	0 %	60 %	40 %	284988632
151	NC_013757	GAT	2	6	4683	4688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284988632
152	NC_013757	GCT	2	6	4713	4718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988632
153	NC_013757	GCC	2	6	4720	4725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988632
154	NC_013757	CGT	2	6	4752	4757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988632
155	NC_013757	GCT	2	6	4794	4799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988632
156	NC_013757	CTG	2	6	4804	4809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988632
157	NC_013757	CG	3	6	4813	4818	0 %	0 %	50 %	50 %	284988632
158	NC_013757	CGA	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284988632
159	NC_013757	GGA	2	6	4860	4865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284988632
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162	NC_013757	AGG	2	6	4964	4969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284988632
163	NC_013757	CGC	2	6	4992	4997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284988632
164	NC_013757	CAG	2	6	5005	5010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284988632
165	NC_013757	CGG	2	6	5013	5018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284988632
166	NC_013757	AGG	2	6	5045	5050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284988632
167	NC_013757	ACC	2	6	5074	5079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_013757	C	6	6	5083	5088	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
169	NC_013757	CGC	2	6	5090	5095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
170	NC_013757	G	6	6	5147	5152	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013757	ACCTC	2	10	5163	5172	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
172	NC_013757	GCT	2	6	5176	5181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_013757	TCG	2	6	5267	5272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988633
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175	NC_013757	CG	3	6	5395	5400	0 %	0 %	50 %	50 %	284988633
176	NC_013757	GCT	2	6	5424	5429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988633
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179	NC_013757	GCT	2	6	5505	5510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988633
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201	NC_013757	CGA	2	6	6258	6263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284988633
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233	NC_013757	CCGG	2	8	7092	7099	0 %	0 %	50 %	50 %	284988635
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254	NC_013757	CG	3	6	7681	7686	0 %	0 %	50 %	50 %	284988635
255	NC_013757	GCT	3	9	7713	7721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988635
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259	NC_013757	CCGG	2	8	7776	7783	0 %	0 %	50 %	50 %	284988635
260	NC_013757	CAC	2	6	7810	7815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284988635
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267	NC_013757	GC	3	6	8004	8009	0 %	0 %	50 %	50 %	284988636
268	NC_013757	GCCG	2	8	8054	8061	0 %	0 %	50 %	50 %	284988636
269	NC_013757	GCT	2	6	8065	8070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988636
270	NC_013757	CGT	2	6	8074	8079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988636
271	NC_013757	TCG	3	9	8088	8096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988636
272	NC_013757	CTG	2	6	8099	8104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988636
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274	NC_013757	CTG	2	6	8138	8143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988636
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300	NC_013757	GCT	2	6	8929	8934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284988636
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494	NC_013757	CCT	2	6	15364	15369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
495	NC_013757	GCCC	2	8	15374	15381	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
496	NC_013757	GCCCC	2	10	15407	15416	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
497	NC_013757	GGA	2	6	15434	15439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
498	NC_013757	CCCG	2	8	15482	15489	0 %	0 %	25 %	75 %	284988640
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500	NC_013757	GCAGC	2	10	15526	15535	20 %	0 %	40 %	40 %	284988640

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